Bursa Ovası, tarımsal üretkenliği ve doğal yapısı ile önemli bir ekosisteme sahiptir. Ana Kanal'ın açılmasıyla birlikte bu bölgedeki su yönetimi değişmiş, tarım alanları yeniden şekillenmiştir. Ancak, bu yapılaşma ve sanayileşme süreçleri, ovasının doğal dengesini tehdit eden çevresel sorunları da beraberinde getirmiştir.

Ana Kanal'ın Bursa Ovası üzerindeki etkileri şunlardır:

• Tarım Alanlarının Kazanılması: 1930'lu yıllarda Ana Kanal, Alman Kanalı ve Cenup Kanalı açılarak Bursa Ovası'ndaki bataklıklar kurutulmuş ve tarım arazisi haline getirilmiştir.
• Çevre Kirliliği: Sanayileşme, özellikle Nilüfer Çayı'nı kirletmiş ve su kaynaklarının azalmasına neden olmuştur.
• Yapılaşma Baskısı: Kanalın açılmasından sonra geçen 90 yılda, Bursa Ovası yapılaşma nedeniyle tarım arazilerini kaybetmiştir. 1984 yılında 19 milyon 911 bin metrekare, 2020 yılında ise 115 milyon 290 bin metrekare tarım alanı yapılaşmaya kurban gitmiştir.

BUMİAD'ın raporuna göre, bu kaybın devam etmesi durumunda 2040 yılında Bursa Ovası'nın tamamen tarım dışı bir alan haline gelmesi riski bulunmaktadır.