Aya Panayia Kilisesi, mimari açıdan dikkat çekici unsurlarıyla tarihi ve kültürel bir miras niteliği taşımaktadır. 19. yüzyılda inşa edilen bu yapı, Bizans mimarisinin izlerini günümüzde de yaşatmaktadır. İç ve dış tasarımında kullanılan özgün malzemeler, kilisenin ruhunu ve estetik değerini yansıtırken, yapının plan ve düzeni de ziyaretçilerini etkileyen unsurlar arasındadır.

Aya Panayia Kilisesi'nin mimari özellikleri:

• İnşa Yılı ve Konum: 1835 yılında inşa edilmiştir ve Çanakkale'nin Gökçeada ilçesindeki Çınarlı Mahallesi'nde yer alır.
• Mimari Tarz: Bizans dönemi kiliselerinin karakteristik özelliklerini taşır. Kubbe, kemer ve sütun gibi elemanlar belirgin bir şekilde görülür.
• Plan ve Düzen: Dikdörtgen planlı, üç nefli ve apsisli bazilikal bir düzene sahiptir.
• Girişler: Kuzey, güney ve batı cephelerinde üçgen alınlıklı giriş kapıları bulunur; bu kapılarda haç motifleri ve kitabeler yer alır.
• Apsis Bölümü: Beşgen dış cepheli olup, üç büyük ve üç küçük pencereyle aydınlatılır.
• Malzeme: Dış cephede kaba yontu taş duvarlar, iç mekânda ise ahşap tavan ve ahşap iskeletli kırma çatı yapısı dikkat çeker.
• Süslemeler: İncil sahnelerini ve dini motifleri anlatan freskler bulunur, ancak bu fresklerin büyük bir kısmı zarar görmüş veya üzeri boyanmıştır.