Doğal sit alanları, çevresel korunma ve sürdürülebilirlik hedefleri doğrultusunda, ekosistemlerin ve doğal kaynakların korunması amacıyla tanımlanır. Bu süreç, çeşitli ekolojik ve jeolojik faktörlerin dikkate alınarak alanların belirlenmesini içerir. Alanların korunması gereken özellikleri ve biyoçeşitliliği, doğal sit statüsü kazandırılmadan önce titiz bir analiz sürecine tabi tutulur. Böylece, ekosistemlerin sürdürülebilirliği sağlanırken, aynı zamanda doğal güzelliklerin de korunması hedeflenir.

Doğal sit alanları, biyolojik çeşitlilik, ekosistemler, jeolojik oluşumlar veya doğal güzellikler gibi doğal kaynakların korunması amacıyla belirlenir. Doğal sit alanı belirleme süreci:

1. Ekolojik çalışmalar: Alanın tür çeşitliliği (flora ve fauna) ve habitat özellikleri saptanır. Kritik türler ve bu türlerin habitatlarla ilişkileri belirlenir.
2. Alan sınırlarının belirlenmesi: Çalışma alanı sınırları, mutlak korunması gereken tür ve habitatların yayılım alanları dikkate alınarak belirlenir. Ayrıca, jeolojik ve jeomorfolojik istisnai özellikler de göz önünde bulundurulur.
3. Koruma kategorilerinin belirlenmesi: Alanın koruma statüsü, Ekolojik Temelli Bilimsel Araştırma Raporu sonuçlarına göre kesin korunacak hassas alanlar, nitelikli doğal koruma alanları veya sürdürülebilir koruma ve kontrollü kullanım alanları olarak belirlenir.

Doğal sit alanı belirleme işlemleri, Çevre, Şehircilik ve İklim Değişikliği Bakanlığı tarafından yürütülür.